O Regimento Interno do TRT/BA regula os casos de substituições. Caso haja a necessidade do afastamento do Vice-Presidente, durante o segundo ano de mandato, ele será substituído, na forma da lei, pelo
- A Presidente, de forma cumulativa.
- B Corregedor Regional.
- C Vice-Corregedor Regional.
- D Desembargador mais antigo.
- E Presidente do Órgão Especial.