De acordo com a Portaria 399-GM, de 22 de fevereiro de 2006, em relação ao fortalecimento da capacidade de respostas às doenças emergentes e endemias, dos objetivos e metas para o controle da dengue era:
- A reduzir a menos de 1% a infestação predial por Aedes aegypti em 30% dos municípios prioritários;
- B atingir o patamar de eliminação enquanto problema de saúde pública, ou seja, menos de 1 caso por 10.000 habitantes em todos os municípios prioritários;
- C atingir pelo menos 85% de cura de casos novos diagnosticados a cada ano;
- D reduzir em 15% a incidência parasitária anual, na região da Amazônia Legal.