O Sistema Municipal de Ensino de Cuiabá compreende em sua organização todos os Órgãos e Instituições Educacionais do município, articulando as partes e definindo as competências de cada um em vista das finalidades inerentes às responsabilidades. O sistema de ensino do município de Cuiabá apresenta entre suas diretrizes gerais a/o:
- A valorização da experiência extra-escolar
- B vinculação entre a educação escolar, o trabalho e as práticas sociais
- C preservação, difusão e expansão dos patrimônios cultural e ambiental
- D pluralismo de ideias e coexistência de estabelecimentos públicos e privados de ensino