Uma lista de picos (peak list) gerada por MALDI-TOF contém, no mínimo, informações sobre:
- A Pares de valores de massa e valores de área sobre o pico extraídos das médias dos picos originais.
- B Intensidade relativa dos íons, tempo de retenção cromatográfica e número de transições de carga para cada pico detectado.
- C Carga dos íons, comprimento de onda do laser e energia de ionização de cada pico observado.
- D Pares de valores de razão massa-carga (m/z) e valores de intensidade extraídos dos picos centroides originais.
- E Deconvolução das massas de picos isotópicos e soma das cargas dos picos identificados.