O metabarcoding é uma ferramenta poderosa para caracterizar comunidades microbianas a partir de amostras ambientais, utilizando sequências curtas de marcadores genéticos. A construção de bibliotecas de DNA envolve etapas críticas, como extração de DNA, amplificação e controle de qualidade das sequências geradas. O sucesso do experimento depende de uma série de fatores, incluindo a qualidade da amostra inicial, a seleção do marcador genético e a aplicação de filtros rigorosos para eliminar artefatos e contaminações. Assinale a alternativa que melhor descreve as estratégias de controle de qualidade de sequências utilizadas para reduzir a ocorrência de OTUs (Unidades Taxonômicas Operacionais) espúrias em análises de metabarcoding.
- A A utilização de primers universais elimina a necessidade de filtragem de sequências contaminantes, garantindo que todas as leituras representem organismos da amostra original.
- B O uso de sequências de referência conhecidas permite remover qualquer OTU que não esteja previamente catalogada em bases de dados, garantindo apenas a presença de espécies já identificadas.
- C A exclusão de todas as sequências de baixa abundância evita falsos positivos, mas pode levar à perda de espécies raras que são biologicamente relevantes para a comunidade estudada.
- D O controle de qualidade inclui a remoção de sequências de baixa qualidade, o corte de adaptadores, a filtragem de contaminações e a aplicação de limiares estatísticos para minimizar erros de amplificação e sequenciamento.
- E A normalização da abundância das OTUs pelo número total de reads garante que todas as espécies sejam igualmente representadas, evitando viés na detecção de organismos minoritários.