Questões de A química da vida (Biologia)

Biologia Moléculas, células e tecidos | A química da vida

Universidade de São Paulo (USP) - Especialista em Laboratório (Especialidade: Informática Biológica) - FUVEST (2025)

Software de análise ômica, como Cytoscape, String, ClueGO, Reactome e KEGG, permitem a interpretação integrada de grandes volumes de dados biológicos. Esses programas auxiliam na visualização de redes de interação molecular, enriquecimento funcional e associação de genes a vias metabólicas e processos celulares. A correta aplicação dessas ferramentas melhora a inferência de mecanismos biológicos subjacentes a diferentes fenótipos observados. Qual é a alternativa que melhor descreve a aplicação de um desses software na análise de dados ômicos?

A String é um software usado exclusivamente para análise de expressão gênica diferencial, permitindo comparar a abundância de transcritos entre diferentes condições experimentais.
B KEGG é um software de visualização de redes biológicas que permite prever interações entre proteínas com base em coexpressão gênica e experimentos de ligação molecular.
C Cytoscape permite identificar exclusivamente proteínas que participam de vias metabólicas, mas não é útil para a análise de redes de interação gênica.
D Reactome oferece análise de enriquecimento funcional, mas sua base de dados não é atualizada periodicamente, dificultando a integração com dados ômicos recentes.
E ClueGO é um plugin do Cytoscape que permite a análise integrada de enriquecimento funcional, combinando termos de Gene Ontology (GO) e vias de KEGG, ajudando a interpretar redes de interações moleculares.

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Universidade de São Paulo (USP) - Especialista em Laboratório (Especialidade: Informática Biológica) - FUVEST (2025)

A integração de diferentes camadas de dados ômicos, como genômica, transcriptômica, proteômica e metabolômica, é um desafio fundamental na biologia de sistemas. Um dos obstáculos é a alta dimensionalidade dos dados, o que pode dificultar a interpretação e levar a correlações espúrias. Estratégias como a redução de dimensionalidade (por exemplo: PCA), correlação entre dados distintos e a construção de redes de interação ajudam a identificar padrões biológicos significativos e inferir relações funcionais entre genes, proteínas e metabólitos. Diante desse contexto, qual das alternativas a seguir apresenta corretamente um benefício da construção de redes de coexpressão gênica na integração de dados multiômicos?

A A construção de redes de coexpressão gênica permite identificar módulos funcionais, agrupando genes que apresentam padrões de expressão correlacionados, o que pode sugerir regulação compartilhada e participação em vias biológicas específicas.
B análise de redes de coexpressão reduz automaticamente a dimensionalidade dos dados, eliminando genes não expressos e garantindo que todos os genes no módulo tenham papel funcional relevante.
C Redes de coexpressão gênica garantem que genes altamente expressos sejam priorizados nas análises, uma vez que a abundância de transcritos é o principal fator determinante para a funcionalidade biológica.
D A utilização de redes de coexpressão evita a necessidade de análises estatísticas adicionais, pois os genes agrupados em um mesmo módulo necessariamente interagem fisicamente entre si.
E Em redes de coexpressão, a inclusão de dados metabolômicos ou proteômicos não influencia os resultados, pois a regulação gênica ocorre apenas no nível da transcrição, sem necessidade de outras camadas de informação.

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O metabarcoding é uma ferramenta poderosa para caracterizar comunidades microbianas a partir de amostras ambientais, utilizando sequências curtas de marcadores genéticos. A construção de bibliotecas de DNA envolve etapas críticas, como extração de DNA, amplificação e controle de qualidade das sequências geradas. O sucesso do experimento depende de uma série de fatores, incluindo a qualidade da amostra inicial, a seleção do marcador genético e a aplicação de filtros rigorosos para eliminar artefatos e contaminações. Assinale a alternativa que melhor descreve as estratégias de controle de qualidade de sequências utilizadas para reduzir a ocorrência de OTUs (Unidades Taxonômicas Operacionais) espúrias em análises de metabarcoding.

A A utilização de primers universais elimina a necessidade de filtragem de sequências contaminantes, garantindo que todas as leituras representem organismos da amostra original.
B O uso de sequências de referência conhecidas permite remover qualquer OTU que não esteja previamente catalogada em bases de dados, garantindo apenas a presença de espécies já identificadas.
C A exclusão de todas as sequências de baixa abundância evita falsos positivos, mas pode levar à perda de espécies raras que são biologicamente relevantes para a comunidade estudada.
D O controle de qualidade inclui a remoção de sequências de baixa qualidade, o corte de adaptadores, a filtragem de contaminações e a aplicação de limiares estatísticos para minimizar erros de amplificação e sequenciamento.
E A normalização da abundância das OTUs pelo número total de reads garante que todas as espécies sejam igualmente representadas, evitando viés na detecção de organismos minoritários.

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Universidade de São Paulo (USP) - Especialista em Laboratório (Especialidade: Informática Biológica) - FUVEST (2025)

Os dados obtidos em experimentos ômicos podem conter variações técnicas e biológicas que influenciam a análise. Para minimizar esses efeitos, diferentes estratégias são aplicadas antes da interpretação dos resultados. Assinale a alternativa que melhor descreve a importância do pré-processamento e normalização na análise de dados ômicos.

A O pré-processamento de dados ômicos é dispensável quando se utiliza equipamentos modernos, pois leituras de baixa qualidade não influenciam significativamente a análise.
B A normalização dos dados transcriptômicos é necessária apenas quando se deseja comparar amostras coletadas em momentos distintos, sendo desnecessária para análises em um único experimento.
C A filtragem de dados em microbiômica é importante apenas para remover leituras de baixa qualidade, mas não impacta na identificação de espécies microbianas.
D Em proteômica, a remoção de contaminantes é irrelevante, pois algoritmos de identificação já conseguem distinguir proteínas reais de artefatos experimentais.
E O pré-processamento de dados ômicos é crucial para reduzir erros, melhorar a reprodutibilidade e evitar vieses, garantindo que a interpretação dos resultados seja confiável.

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Prefeitura de Caconde - Biólogo - Avança SP (2025)

Em relação as características químicas da água, analise as afirmativas abaixo atribuindo (V) para Verdadeira e (F) para Falsa, em seguida assinale a alternativa com a sequência correta.

( ) O potencial hidrogêniônico (pH) representa a intensidade das condições ácidas ou alcalinas do meio líquido por meio da medição da presença de íons hidrogênio (H+).

( ) As alterações de pH podem ter origem natural (dissolução de rochas, fotossíntese) ou antropogênica (despejos domésticos e industriais).

( ) Os parâmetros DBO (Demanda Bioquímica de Oxigênio) e DQO (Demanda Química de Oxigênio) são utilizados para indicar a presença de matéria orgânica na água

A F, V, V
B V, F, F
C V, V, V
D V, V, F
E F, F, V