Algumas bactérias possuem mobilidade por meio de flagelos, que podem ser vistos em alguns bacilos gram-negativos. Técnicas de coloração são utilizadas para destacar os flagelos, como é o caso do método de
- A Rhodes, em que as bactérias ficam coradas em castanho-escuro e os flagelos mais claros em fundo ligeiramente granuloso.
- B Ziehl-Nielsen, com o flagelo das bactérias gram-negativas corado em azul-escuro em contraste com a coloração vermelha da bactéria.
- C Gram, em que os flagelos não são descorados na etapa de diferenciação e mantêm a coloração roxa em contraste com a coloração vermelha da bactéria.
- D Nigrosina-Eosina, em que os flagelos são corados em vermelho pela eosina em contraste com a cor de fundo escura proporcionada pela nigrosina.
- E Coloração pela safranina, que cora em vermelho as bactérias e os flagelos, em contraste com o fundo verde-claro da lâmina dado pelo corante verde malaquita.